分居期间房贷仍由夫妻共同偿还。因为只是分居并未离婚，无论因为什么而分居，也不管分居达到多长时间，只要双方未办理离婚手续，婚姻关系就依法存在，婚姻关系存续双方就对共同债务负有偿还的责任。

【法律依据】

《婚姻法》第41条，离婚时，原为夫妻共同生活所负的债务，应当共同偿还。共同财产不足清偿的，或财产归各自所有的，由双方协议清偿；协议不成时，由人民法院判决。