支付赔偿款应作为营业外收入入账，受让方支付的赔偿款视情况作增加相关项目的营业成本或作营业外支出进行账务处理。企业应通过“营业外支出”科目，核算营业外支出的发生及结转情况。确认处置非流动资产损失时，借记“营业外支出”科目，贷记“固定资产清理”、“无形资产”、“原材料”等科目。