常见的建设工程合同纠纷如下：

1、施工合同的效力问题；

2、合同无效是否进行结算；

3、备案合同和“补充协议”，即黑白合同不一致，在结算时应采纳哪一份合同作为结算的依据；

4、对建设部推荐施工合同版本通用条款中涉及的发包方逾越不结算是否认可送审价的问题；

5、工程结算采取何种的标准问题；

6、诉讼中，造价司法鉴定的范围；

7、关于工程质量、工期、农民工利益问题。

【法律依据】

《合同法》第二百七十五条，施工合同的内容包括工程范围、建设工期、中间交工工程的开工和竣工时间、工程质量、工程造价、技术资料交付时间、材料和设备供应责任、拨款和结算、竣工验收、质量保修范围和质量保证期、双方相互协作等条款。