水龙卷的原理是它的上端与雷雨云相连，下端与水面相接，水以涡流的形式绕着轴心从水面旋转上升到天空。其持续时间比陆上龙卷风要长，强度也较大，运动过程中上部会因气流的原因向特定方向倾斜，同时会发生壮观的“龙吸水”景象。