专利侵权证据的保全方式主要有以下两种方式：

(一)公证保全方式

公证保全，一般是专利权人及其利害关系人就存在的侵权行为，向公证机关提出申请，对其购买侵权产品的过程及购得的侵权产品进行公证，或对侵权现场(如许诺销售)或对侵权产品的安装地进行勘查公证，取得公证书，从而证明被告存在侵权行为。

(二)法院证据保全方式

法院保全证据方式，即通常所说的民诉法意义上的“证据保全”，指的是了防止证据的自然灭失、人为毁灭或者以后难以取得，经诉讼参加人申请或者人民法院依职权主动开始，人民法院对民事诉讼证据加以收集和固定的制度。法院证据保全有两种形式：一是诉前证据保全和诉讼中证据保全。

法律依据：

我国《民事诉讼法》第六十四条规定：当事人及其代理人因客观原因不能自行取得的证据，或者人民法院认为审理案件需要的证据，人民法院应当调查收集。基于此当事人往往在提起专利侵权，商标侵权和著作权侵权诉讼的同时，提出一份调取证据申请。