1如果是收到保函保证金，那么通过“其他应付款”科目核算，分录为：

借：银行存款

贷：其他应付款

2如果是支付保函保证金，那么通过“其他应收款”科目核算，分录为：

借：其他应收款

保函费是当事人双方约定，债务人或第三方或向债权人给付一定的金额，作为其履行债务的担保，债务履行时，返还押金或予抵扣，债务不履行时，债权人得就该款项优先受偿。