好医保住院医疗是有免赔额的，免赔额的具体情况如下：

1、一般疾病及意外医疗：免赔额1万元，超过1万元的部分赔付。

2、100种重大疾病：扣除医保报销的部分，0元免赔。

注意：医保个人账户和其他商业保险赔付的金额均可以用来抵扣免赔额。