企业自建办公楼是要交房产税的，房产税与房屋是不是由单位自建无关，而是与单位的性质、房产的使用性质以及房产是否属于房产税的开征区域范围有关。房产税是为中外各国政府广为开征的古老的税种，是以房屋为征税对象，按房屋的计税余值或租金收入为计税依据，向产权所有人征收的一种财产税。根据《中华人民共和国房产税暂行条例》第五条规定，下列房产免纳房产税：

1、国家机关、人民团体或者是军队自用的房产。

2、由国家财政部门拨付事业经费的单位自用房产。

3、宗教寺庙或者是公园名胜古迹自用的房产。

4、个人所有非营业用的房产；（五）经财政部批准免税的其他房产。

凡在房产税开征区域而又不属于上述范围内的房产，一般都是应税房产，都要依法申报缴纳房产税。