应该计入“研发支出”科目里吧，先费用化处理，如果研发成功了，再进行资本化处理。

因为研发费用可以加计扣除。如果你要加计扣除的话，应该在管理费用下面单独核算，并要经过相应的报备手续。

至于研发后剩余的边角料和产成品，是按照能否销售来看的，如果能够销售，按销售收入或其他业务收入处理。不能销售的成本已经进入研发费用，也就不存在其他问题了。

所得税汇算清缴是否会出麻烦，关键在于，上述处理是否真实。真实的话应该是没有问题的。