北京大学和燕京大学不同的两个大学，北京大学是国立的，而燕京大学是美国教会出资创立的，它的校长是美国驻华大使司徒雷登。建国后国家对大学进行重组燕京大学的文科被并入北京大学理科被并入清华，北京大学搬到原燕京大学的校园燕园，也就是今天北大的校园。

燕京大学建立于1919年，其前身是美国教会在北京一带办的三所教会学校：

汇文大学（PekingUniversity，美以美会，1889－；崇内怀理书院，1870）。校长刘海澜博士（HiramHarrisonLowry)，在崇文门船板胡同的校址后来改办汇文中学

华北协和女子大学（贝满女塾，1864－）灯市口东口的佟府夹道胡同。(校址后来改办贝满女中)

通州协和大学（公理会潞河书院，1867－）。谢卫楼(DavelleSheffield)校长