店内丢东西,员工是否要承担赔偿责任需要具体分析。在不能查清是否是因为个别员工失职的情况下丢失货物,由员工承担损失,这种行为已经侵犯了劳动者的财产权,是不合法的。

【法律依据】

根据《侵权责任法》第三条，被侵权人有权请求侵权人承担侵权责任。