闯红灯被扣6分不可以分开扣，闯红灯扣了6分，需要到违法行为发生地的车辆管理所去处理违章。无论何种理由，发生闯红灯违法行为，都会依法处罚。不过，路口的视频设备每次采集闯红灯违法信息也很谨慎，需要"三堂会审"，也就是说，认定一辆车闯红灯，会有三张照片佐证。分别在车辆过线前，过线后和驶入路口。