依据实际情况而言，《中华人民共和国个人所得税法》的规定缴纳个人所得税。如果公司分两次发放工资，公司作为个人所得税的法定扣缴义务人有依法履行代扣代缴的义务。在一个月内，如果有多次发放工资的应当合并为一次计算个人所得税。如果给员工发放工资时公司未履行代扣代缴义务，取得工资薪金收入的员工作为纳税人有义务主动向税务机关自行申报个人所得税。