个税汇算清缴出现补缴的原因：1、在两个以上单位任职受雇并领取工资薪金，预缴税款时重复扣除了基本减除费用(5000元/月)；2、除工资薪金外，还有劳务报酬、稿酬、特许权使用费，各项综合所得的收入加总后，导致适用综合所得年税率高于预扣率；3、预扣预缴时扣除了不该扣除的项目，或者扣除金额超过规定标准，年度合并计税时因调减扣除额导致应纳税所得额增加；4、纳税人取得综合所得，因扣缴义务人未依法申报收入并预扣预缴税款，需补充申报收入等。