曲水县位于雅鲁藏布江中游河谷地带，地势低平。念青唐古拉山的一条去脉逶迤北部，南坡蜿蜒长达5-20公里的7条山溪，辗转汇入拉萨河和雅鲁藏布江，山沟从高入低，由窄入宽，形成大小不等的冲积扇坡地。谷地最低海拔3501米，山峰最高海拔5895米。