1、性质不同：国债是国家以其信用为基础，通过向社会发行债券筹集资金所形成的债权债务关系，本质是债券;国债逆回购就是个人通过国债回购市场把自己的资金借出去，获得固定的利息收益，本质是短期借款。

2、发行主体不同：国债的发行主体是国家，而国债逆回购可以是国家，也可以是个人。

3、投资品种不同：国债是在一定时期内不断增值的金融资产，而国债逆回购是能为投资者提高闲置资金增值能力的金融品种。