根据《城市房地产管理法》、《物权法》、《房屋登记办法》规定，房屋他项权证丢失办理流程：

1、需要在当地公开发行的报纸媒体上刊登遗失声明，进行登报挂失。

2、房地产抵押权设立登记申请表原件；

3、房产档案馆查档证明原件；

4、登报声明《房屋他项权证》遗失作废的公告；

5、房屋所有权证复印件（校对原件）；

6、抵押权人及抵押人共同出具的情况说明；

7、提供有关证件。