机动车驾驶人驾驶抵押车违章被处罚记分的，应当扣机动车使用人即驾驶人的分值。违章行为处罚的是驾驶人员的不遵守交通规则行为，而不是针对车辆的，即交通违法扣分，是指驾驶人在道路行车中不按规定行车，产生相应的交通违法行为，从而导致相应的交通违法扣分。

【法律依据】

《道路交通安全法》第二十四条规定，公安机关交通管理部门对机动车驾驶人违反道路交通安全法律、法规的行为，除依法给予行政处罚外，实行累积记分制度。公安机关交通管理部门对累积记分达到规定分值的机动车驾驶人，扣留机动车驾驶证，对其进行道路交通安全法律、法规教育，重新考试；考试合格的，发还其机动车驾驶证。对遵守道路交通安全法律、法规，在一年内无累积记分的机动车驾驶人，可以延长机动车驾驶证的审验期。具体办法由国务院公安部门规定。