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质子泵可逆ATP酶可以在外部能量驱动下逆浓度转运H。

线粒体呼吸链中有三种具有质子泵功能的酶复合物，能将H从内腔转运到外腔。

它们是细胞色素C氧化酶、辅酶QH2-细胞色素C还原酶和NADH-辅酶Q还原酶。

质子泵普遍存在于细菌的质膜上，有些还伴有呼吸链成分。

嗜盐菌膜上的细菌视紫红质受光驱动，能将H转运到细菌内进行浓缩。