酵母菌内有液泡，液泡主要存在于成熟的植物细胞，另外某些低等原生动物（如草履虫的伸缩泡）有相当于液泡的一种形式；某些真菌酵母菌也有液泡，但不是所有真菌都有液泡。相对而言，酵母菌细胞有细胞壁、细胞膜、细胞核、细胞质、液泡、线粒体、核糖体、内质网等，有些种还有荚膜、鞭毛等。