两院指的是中国科学院和中国工程院。中国科学院是国家科学技术方面最高学术机构和全国自然科学与高新技术综合研究发展中心。中国工程院是我国工程技术界的最高荣誉性、咨询性学术机构。中国科学院主要是研究科学的理论和实验中出现的问题，而中国工程院主要是研究实际工程中出现的问题。