商贷余额就是商业贷款还没有还清的余额部分。在商业贷款转公积金贷款的过程中，需要借款人自筹资金先将商业贷款的贷款余额还清，从而解除房屋他项权的抵押，再将房屋他项权抵押至公积金中心名下，公积金中心再向借款人放款。