公司出售二手车收入做账的方法：

一、固定资产转入清理时：

借：固定资产清理

累计折旧

贷：固定资产

二、收到价款时：

借：银行存款

贷：固定资产清理

应交税费—应交增值税

持税务登记证副本等有关证件、固定资产核算账证复印件、《机动车行驶证》复印件等资料，到税务局领取《政策性减免税项目提请备案表(旧机动车交易)》办理纳税申报和税款征收。凭手续并取得税款缴纳凭证后，到二手车交易市场开具《二手车销售统一发票》完成过户手续。