南通大学医学院是二本学院，前身为南通医学院，源于1912年民族实业家、教育家张謇先生创立的南通医学专门学校，至今已有一百多年的办学历史。

2004年原南通医学院、南通工学院、南通师范学院组建南通大学，原南通医学院分设为南通大学基础医学院、临床医学院等学院。2006年9月，原南通大学基础医学院和临床医学院合并组建南通大学医学院。

开设专业：学院现有临床医学、口腔医学、医学影像学、康复治疗学、药学等12个本科专业和专业方向。

获奖情况：获国家技术发明二等奖1项、江苏省科学技术进步一等奖2项、承担国家级科研项目107项、部省级科研项目32项、获发明专利25项、实用新型专利66项。