青海大学医学院始建于1958年9月，1995年青海藏医学院并入学院，2004年11月与青海大学整合组建新的青海大学，青海医学院更名为青海大学医学院。青海大学医学院建院四十多年来，已经形成普通教育、成人教育、继续医学教育为一体的多层次、多形式的办学格局，是一所具有鲜明地方、民族特色的医科院校。

2012年，学院下设临床医学系、中医学系、藏医学系、公共卫生系、药学系等五系20个本科专业或专业方向和基础医学部、公共学科部、高原医学研究中心、现代教育技术中心、寄生虫病研究所、图书馆、成人教育学院和附属医院。高原医学、藏医学、地方病学等特色专业在全国医药院校中享有较高声誉，已成为西北地区一所具有高原区位优势和民族特色的医科院校。学院占地140亩，图书馆藏书19万册。《青海大学医学院学报》面向国内外公开发行。