清华大学深圳研究生院主要有：土木工程、环境科学与工程 、仪器科学与技术 、管理科学与工程 、电气工程 、电子科学与技术 、信息与通信工程 、计算机科学与技术 、控制科学与工程 、材料科学与工程 、物理学 、化学 、生物学 、海洋科学 、应用经济学 、工商管理 、哲学 、教育学 、艺术学 、生物医学工程等。

清华大学深圳研究生院直属清华大学，是清华大学与深圳市合作创建的高层次人才培养基地和科技创新基地。作为清华大学唯一的异地办学机构，深圳研究生院是清华创建世界一流大学的组成部分。 深圳研究生院将在高层次人才培养、原创性科学研究、高科技成果转化诸方面努力为深圳市乃至中国的经济和社会发展服务。