去除多糖溶液中的蛋白质杂质的方法如下：

1、采用蛋白酶进行分解蛋白质，尝试使用百分之一至百分之三的蛋白酶在50至60摄氏度下水浴加热1至3小时；

2、过滤、浓缩，用乙醇沉淀、分离、洗涤干燥得粗多糖；

3、可用Sevag法、三氟三氯乙烷法等精制多糖，即可去除蛋白质杂质。