微生物的营养方式有：腐生、寄生、自养。

微生物是指一切肉眼看不到或看不清楚，因而需要借助显微镜观察的微小生物。微生物包括原生动物、真菌和细菌、病毒。其中病毒属于寄生生活。细菌有营寄生生活的，有营腐生生活的。真菌有营寄生生活的，也有营腐生生活的，也有自养的，例如蓝藻等。

腐生是生物体获得营养的一种方式。凡从动植物尸体或腐烂组织获取有机物维持自身生活的生物叫“腐生生物”。大多数霉菌、细菌、酵母菌及少数高等植物都属“腐生生物”。

寄生即两种生物在一起生活，一方受益，另一方受害，后者给前者提供营养物质和居住场所，主要的寄生物有细菌、病毒、真菌和原生动物。

自养即利用自己制造的有机物来维持生活的营养方式。