防城区中学有：1.防城中学，前身为清未三都书院，是防城港历史悠久的中学。2.防城港市实验高级中学，其前身是创办于1961年的广西省东兴县师范附小。

港口区中学有：1.防城港市第一中学，创建于1987年。2.防城港市高级中学，创建于2000年。

防城港没有大学。