促进土壤有机质及氮、磷、钾等含量的增加，协调比例失调的矛盾；提高土壤水分的保蓄能力，能有效增加土壤有机质含量，改良土壤、加速生土熟化、提高土壤肥力；补充土壤养分。作物秸秆含有一定养分和纤维素、半纤维素、木质素、蛋白质和灰分元素，既有较多有机质，又有氮、磷、钾等营养元素；促进了微生物活动。土壤微生物在整个农业生态系统中具有分解土壤有机质和净化土壤的重要作用，给土壤微生物增添了大量能源物质，各类微生物数量和酶活性也相应增加，这就加速了对有机物质的分解和矿物质养分的转化，使土壤中的氮、磷、钾等元素增加，土壤养分的有效性也有所提高；可减少化肥使用量。作物所吸收的氮主要来自土壤中的原有氮素。来自化肥的仅占百分之23至百分之24，这说明即使施用化肥，土壤有机物对作物生长仍是最重要的。所以，秸秆还田是弥补化肥长期使用缺陷的极好办法；可改善农业生态环境，杜绝了秸秆焚烧所造成的大气污染。