心理学是一门将人视为客体的学科，而精神学则将人视为主体。可见，这是它们第一个在主体性和客体性上的差别。另外一个差别在于，大多数心理学家研究的是人类的意识这一部分，而所有精神分析家都集中精力于人类的无意识。由此，第二个差别便存在于意识和无意识的区分上。也正是由于这个原因人们认为精神分析很神秘，因为它研究的是存在于每个人中的无意识。这赋予了精神分析学一种神秘的特色。