三国时别驾的官职是州刺史的佐官，全称是别驾从事使，因其地位较高，出巡时不与刺史同车，别乘一车，故名，且在隋初废郡存州，改别驾为长史，而唐初改郡丞为别驾。在唐高宗时期，又改别驾为长史，另以皇族为别驾，后废置不常，宋各州的通判，职任似别驾，后世因以别驾为通判之习称。