可能有以下两个原因：

1、港澳通行证读取机出现故障，此时更换读取机重新读取信息即可。

2、港澳通行证芯片损坏，此时应携带居民身份证原件、港澳通行证照片以及符合非常住户口所在地申请条件的证明，去往当地出入境部门申请更换港澳通行证。