喉结石和扁桃体结石不一样，喉结石一般指喉部结石，由于咽喉部炎症，加上吸入的粉尘粘附滞留而成，叫做“喉结石”，常伴有咽喉肿痛，有异物梗塞感，有时结石可咳出。

扁桃体结石多发生于扁桃体上隐窝中，长期处于阻塞，分泌物引流不畅，导致干酪样物积聚，致不易溶解的钙、镁等无机盐沉积而成结石。