灵活就业人员不算是劳务关系。原因以及纠纷解决的方法：

个体户、农民工、自由职业者等都属于灵活就业人员范畴。如果与用人单位存在劳动合同关系或者事实劳动合同关系，应当适用劳动法律法规调整，否则属于民事、商事关系，适用民法、经济合同法等调整。