三本毕业发的是本科学士学位。

从“学位”来说，三本的本科仍然由具有学位授予单位颁发。和重点本科（一本），一般本科（二本）完全一样的。 但是毕业证是有所区别的。很多三本都是连合办学或者二级独立学院等等方式办学，毕业证上面可能会出现两个印章或者二级学院的印章。