三门县辖10个镇、4个乡：海游镇、沙柳镇、珠岙镇、亭旁镇、六敖镇、横渡镇、健跳镇、浬浦镇、花桥镇、小雄镇；高枧乡、沿赤乡、泗淋乡、蛇蟠乡。海游镇为全县的政治、经济、文化中心。

三门县位于台州东北部沿海，西枕天台山，东濒三门湾，北接宁海县，南毗临海市。东西宽50公里，南北长38公里，总面积1072平方公里。海岸线长167公里，海域约500平方公里，沿海岛屿122个。地势西北高， 东南低；中、西部为低山丘陵地区，间有小块河谷平地，东部为滨海平原，河道纵横，土壤肥沃。