微生物分为原核、真核和非细胞三大类。

原核有细菌、放线菌、螺旋体、支原体、立克次氏体和衣原体。 　　

真核有真菌 、藻类和原生动物。

非细胞类有病毒和亚病毒。

微生物是个体难以用肉眼观察的一切微小生物之统称。