自制酸奶有水的原因如下：

1、原因：牛奶中干物质含量低，即牛奶水分多，比较稀，出水肯定比较多。

解决方法：选择干物质含量高的牛奶或者添加奶粉提高牛奶中干物质含量；

2、原因：发酵时间过长，导致乳清析出。

解决方法：缩短发酵时间；

3、原因：酸化过度，菌粉加多了，容器震动剧烈。

解决方法：选用产酸平稳的发酵剂，减少震动，提高杀菌温度。