报关单中填报合同协议号的方法：

1、合同协议号可填报进出口货物单的合同协议编号的全部字头和号码；

2、使用《征免税证明》和《加工贸易手册》进口的投资设备和加工贸易进口料件，填写的合同协议号应与《征免税证明》和《加工贸易手册》上备案的合同号码一致；

3、合同协议号与发票一致，可在发票等单证上找到合同或协议号。