1368年中原局势彻底失控，元惠宗出逃大都，坐镇蒙古继续指挥各路元军镇压民乱。此后北元几度南征都未能重占大都，到1389年在蓝玉率领的明军进攻下灭亡。

北元是蒙古族在蒙古草原建立的政权。1368年元惠宗迁都滦京，仍以“大元”为国号，因地处塞北，故称“北元”。共传二位皇帝，享国二十一年。北元虽偏安于蒙古高原，却是蒙古族历史上经济文化繁荣、科技进步、对外开放程度较高的时期。