1、引物，引物是PCR特异性反应的关键，PCR产物的特异性取决于引物与模板DNA互补的程度。

2、酶，目前有两种聚合酶供应。

3、dNTP，dNTP的质量与浓度与PCR扩增效率有密切关系，dNTP粉呈颗粒状。

4、模板，模板核酸的量与纯化程度，是PCR成败与否的关键环节之一。

5、镁离子浓度，镁离子对PCR扩增的特异性和产量有显著影响。