安徽工程大学研究生院有5个博士后科研流动站、11个博士学位授权一级学科、49个博士学位授权点、31个硕士学位授权一级学科、146个硕士学位授权点、9个一级学科硕士点、17个专业硕士学位授权点，是一个很不错的研究生院。

安徽大学是国家"211工程"重点建设高校，安徽省属重点综合性大学。2013年8月教育部与安徽省人民政府发布关于共建安徽大学的文件，安徽大学成为安徽省属高校中，唯一一所省部共建的高校。根据共建协议，教育部将安徽大学发展建设纳入教育部相关整体规划。