清朝初期，正黄旗的旗主是皇帝。

八旗旗主分别是：

1、正黄旗：旗主是努尔哈赤 。

2、镶黄旗：旗主是努尔哈赤 。

3、正白旗：旗主是努尔哈赤的第八子皇太极。

4、镶白旗：旗主是努尔哈赤的第十二子阿济格。

5、正、镶红旗：旗主是努尔哈赤的次子代善 。

6、正蓝旗：旗主是努尔哈赤的侄子阿敏。

7、镶蓝旗：旗主是努尔哈赤的第五子莽古尔泰。