男鞋的尺码按厘米计算的话，39号的鞋比40号的鞋要短0.5厘米。

计算方式：鞋的厘米数等于鞋的号数加上10后再除以2。

40号的鞋换算成厘米就是25厘米，而39号的鞋换算成厘米就是24点5厘米；也就是39号的鞋比40号的鞋差了零点五厘米。