因为三个明朝皇帝未被葬在明十三陵，具体如下：

1、明太祖朱元璋。朱元璋在位时，明朝首都为南京，朱元璋死后，便葬在南京；

2、建文帝朱允文。朱允文在八王之乱后失踪，下落不明，故而没有陵墓；

3、明代宗朱祁钰。朱祁钰在其兄朱祁镇落难时称帝，后朱祁镇被放回后，夺回皇位，将朱祁钰的帝号废除，所以明代宗朱祁钰不能按皇帝之礼安葬。