1、南京农业大学具有良好的研究生培养条件还有指导力量，现有四个一级学科国家重点学科，三个二级学科国家重点学科，一个国家重点培育学科，八个学科入选江苏高校优势学科建设工程项目，五个江苏省一级学科重点学科；

2、培养研究生的学科专业涉及哲学、经济学、法学、文学、历史学、理学、工学、农学、医学、管理学等十个学科门类；

3、2000年开始专业学位研究生培养，有兽医博士、兽医硕士、农业硕士、工程硕士、公共管理硕士、工商管理硕士、风景园林硕士、会计硕士、金融硕士、翻译硕士、国际商务硕士、社会工作硕士、中药学硕士、法律硕士和图书情报硕士等15种专业学位授予权；

4、研究生还有以下专业，科学技术哲学，金融学，产业经济学，国际贸易学，国际商务，经济法学，社会学，马克思主义基本原理，思想政治教育，社会工作，外国语言文学，翻译专门史，数学，化学，地图学与地理信息系统，海洋科学，植物学，动物学等。