南京博物院在地铁2号线明故宫站下，公交线路为地铁1号线转地铁2号线，全程约10、2公里。

从南京站乘坐地铁1号线,经过5站，到达新街口站。步行约100米，换乘地铁2号线。乘坐地铁2号线,经过3站，到达明故宫站。步行约920米，到达南京博物院。