辣椒留种采用收株选结合果选的方法，即在田间根据品种特征选择标准株贴上标志，作为留种株。将其第一层果早日采收上市，留2至4层果作为种果，种果红熟后采收时，进一步选择具有本品种特征的果实，采摘的种果摊放在阴凉处，后熟5至7天，剖开取出种子，晾干后贮藏。