京杭运河的流向、水源和排蓄条件在各段均不相同，非常复杂，流向总体概括为四个节点、五种流向：

1、节点1天津的海河以北的通惠河、北运河向南流；

2、节点1与节点2东平湖之间的南运河、鲁北运河向北流；

3、节点2与节点3长江的支流清江之间的鲁南运河、中运河、里运河向南流；

4、节点3与节点4长江以南的丹阳之间河段向北流；丹阳以南河段即江南运河向南流。